Nome: Daniela
Cognome: Evangelista
Posizione: Researcher
Telefono: (Office) +39 0825 299 107
Telefono: (Lab) +39 0825 299 107
Fax: +39 0825 299 641
e-mail: daniela.evangelista@isa.cnr.it
CNR People WEB http://www.cnr.it/people/danielaevangelista
Keywords: Bioinformatics, Clinical Data Mining, Health, Web resource, Machine Learning
Curriculum EN: (clicca qui per vederlo)
Attività di Ricerca
Daniela Evangelista ha conseguito la laurea con lode in Informatica presso l’Università degli studi di Napoli “Federico II” e il dottorato di ricerca in Biologia Computazionale presso l’Università della Campania “L. Vanvitelli”. Ha iniziato la sua attività presso il CNR nel 2011, prima presso l’Istituto per la Applicazioni di Calcolo (CNR/IAC) di Napoli lavorando all’implementazione di metodi statistici per l’analisi dei dati di Next Generation Sequencing (NGS). Successivamente, in collaborazione con il Centro di Ricerca Oncologica di Mercogliano (CROM) – (Avellino), ha lavorato allo sviluppo di un sistema automatico di supporto alle decisioni per l’identificazione della diagnosi e della prognosi delle malattie metaboliche oncologiche e croniche. Successivamente, con borse di studio post-dottorato, presso l’Istituto di Calcolo e Reti ad Alte Prestazioni (CNR-ICAR) di Napoli, si è occupata di progettazione e sviluppo di strumenti software (web e stand-alone), nonché di banche dati per la raccolta, l’integrazione e l’analisi di omici ( DNA-seq, RNA-seq), dati clinici e sperimentali. Dal 2022 è Research Scientist presso l’Istituto di Scienze degli Alimenti (CNR/ISA) ospitato ad Avellino e si occupa di sviluppo e applicazione di strumenti software di bioinformatica per lo studio degli alimenti -malattie correlate e sulla loro analisi dei dati utilizzando metodi di Machine Learning.
Principali Pubblicazioni
- G Felici, KP Tripathi, D Evangelista, MR Guarracino
A mixed integer programming-based global optimization framework for analyzing gene expression data, Journal of Global Optimization 69 (3), 727-744
- D Evangelista, KP Tripathi, MR Guarracino
An Atlas of annotations of Hydra vulgaris transcriptome, BMC bioinformatics 17 (11), 53-59
- D Evangelista, M Avino, P Tripathi, Kumar, MR Guarracino
A Web Resource on Skeletal Muscle Transcriptome of Primates, Springer International Publishing 9874, pp.273-284
- D Evangelista, A Zuccaro, A Lančinskas, J Žilinskas, MR Guarracino
A web-oriented software for the optimization of pooled experiments in NGS for detection of rare mutations, BMC Research Notes 9 (1), 1
- D Evangelista, M Piccirillo, T Ricciardelli, M D’Aiuto, MR Guarracino
A predictive model for surgical planning in breast cancer treatment, 4th International Conference, IWBBIO 2016, Granada, Spain, pp. 454-462
- D Evangelista*, A Zuccaro, MR Guarracino (*Authors contributed equally)
Transcriptator: an automated computational pipeline to annotate assembled reads and identify non coding RNA KP., Tripathi*, Plos One 10 (11), e0140268
- D Evangelista, KP Tripathi, V Scuotto, MR Guarracino
Hvdbase: A web resource on hydra vulgaris transcriptome, International Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering, 355-362
- M Scarpato*, R Esposito*, D Evangelista*, M Aprile, MR Ambrosio, Claudia Angelini, Alfredo Ciccodicola, Valerio Costa (*Authors contributed equally)
AnaLysis of Expression on human chromosome 21, ALE-HSA21: a pilot integrated web resource, Database 2014
- D Evangelista, G Colonna, M Miele, F Cutugno, G Castello, S Desantis, S Costantini
CDMS (Clinical Data Mining Software): a cytokinome data mining system for a predictive medicine of chronic inflammatory diseases, Protein Engineering, Design & Selection 23 (12), 899-902