{"id":89,"date":"2010-03-12T16:10:00","date_gmt":"2010-03-12T16:10:00","guid":{"rendered":"http:\/\/www.isa.cnr.it\/wp-isa\/?page_id=89"},"modified":"2010-03-12T16:10:00","modified_gmt":"2010-03-12T16:10:00","slug":"cesmaprobio","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/webisa\/?page_id=89","title":{"rendered":"CesmaProBio"},"content":{"rendered":"

Metodologie di Spettrometria di Massa, Proteomica, Metabolomica e Bioinformatica nelle Scienze dell’Alimentazione<\/span><\/strong><\/span>
\n<\/span><\/p>\n

Tematiche di ricerca<\/strong><\/span><\/p>\n
    \n
  • WP1: Proteomica e Metabolomica nelle scienze dell’alimentazione;
    \n– Studio dei meccanismi molecolari alla base delle interazioni tra alimenti e salute dell’uomo,attraverso l’analisi di sistemi cellulari modello
    \n– Studio dei meccanismi epigenetici alla base della regolazione da estrogeni e fitoestrogeni di geni ormono-dipendenti
    \n– Approcci proteomici per lo studio di microrganismi di interesse alimentare e di alimenti (latte,cereali, pomodori, etc.)
    \n– Caratterizzazione di costituenti di piante di interesse alimentare e medicinale<\/span><\/li>\n
  • WP2: Sviluppo di metodologie rapide per la caratterizzazione di alimenti, in termini di autenticit\u00e0, qualit\u00e0 e sicurezza<\/span><\/li>\n
  • WP3: Sviluppi metodologici basati sulla spettrometria di massa:
    \n– Sviluppo di tecniche analitiche per lo studio delle modifiche post-traduzionali delle proteine
    \n– Profiling rapido mediante MALDI-TOF-MS di miscele lipidiche e loro prodotti di ossidazione da matrici alimentari<\/span><\/li>\n
  • WP4: Microbiologia degli alimenti: Studio della microflora naturale di prodotti alimentari<\/span><\/li>\n
  • WP5: Sviluppo e applicazione di strumenti bioinformatici per la caratterizzazione strutturalefunzionale di macromolecole<\/span><\/li>\n<\/ul>\n

    Stato dell’arte<\/strong><\/span><\/p>\n

    Recenti innovazioni strumentali hanno dato impulso a discipline omiche ed approcci di molecular profiling. La spettrometria di massa costituisce il nucleo delle tecnologie per lo studio del proteoma e del metaboloma ed \u00e8 affiancata dalla bioinformatica per gestione e analisi di risultati e predizione di strutture. Grazie a questa piattaforma innovativa e all’integrazione tra le differenti competenze dei ricercatori della commessa, l’attivit\u00e0 scientifica \u00e8 stata incentrata su tematiche che spaziano dalle scienze dell’alimentazione alle scienze della vita. Scopo delle nostre attivit\u00e0 di ricerca \u00e8 anche quello di utilizzare metodologie di spettrometria di massa per affrontare in maniera innovativa problematiche inerenti la chimica, biochimica e tecnologia degli alimenti e sviluppare strumenti analitici rapidi, accurati e affidabili, per il controllo della qualit\u00e0 e sicurezza alimentare, che possano sostituire o integrare metodologie gi\u00e0 consolidate. Ci\u00f2 risponde ad una richiesta sempre pi\u00f9 pressante sia degli organi di controllo che dei consumatori e dei produttori, anche a causa di nuove problematiche introdotte dalla liberalizzazione e dalla globalizzazione dei mercati.<\/span><\/p>\n

    Competenze, strumentazione, tecniche di indagine e tecnologie<\/strong><\/span><\/p>\n

    – Competenze (conoscenze possedute dai partecipanti alla commessa rilevanti ai fini del suo svolgimento)<\/em><\/strong><\/span><\/p>\n

      \n
    • Chimica, biochimica, chimica analitica, biologia molecolare, biologia cellulare, microbiologia, tecnologie alimentari, bioinformatica e biologia computazionale.<\/span><\/li>\n
    • Tecniche analitiche basate sulla spettrometria di massa (a singolo stadio, tandem e<\/span><\/li>\n
    • multicollisionale), proteomica e metabolomica.<\/span><\/li>\n
    • Metodiche di analisi del DNA.<\/span><\/li>\n
    • Metodi di elettroforesi mono e bidimensionale e di cromatografia in fase liquida e gassosa.<\/span><\/li>\n
    • Metodi per l’isolamento e la caratterizzazione di microrganismi di interesse alimentare<\/span><\/li>\n
    • Strumenti bioinformatici per l’analisi di dati sperimentali da studi “omici”, per il modellamento di proteine, per lo studio delle interazioni proteina-proteina e proteina-ligando<\/span><\/li>\n<\/ul>\n

      – Strumentazione (dispositivi, apparecchiature o impianti utilizzati per lo svolgimento delle attivit\u00e0)<\/em><\/strong><\/span><\/p>\n

        \n
      • PROTEOMEWORKS SYSTEM (Micromass) composto da: Sistemi di elettroforesi mono e bidimensionale; Analizzatore di immagine e spot-cutter; Robot (MassPrep) per il processamento automatico di campioni<\/span><\/li>\n
      • Spettrometri di massa tandem ibridi Q-TOF accoppiati a sistemi cromatografici capillari, analitici e UPLC<\/span><\/li>\n
      • Spettrometri di massa MALDI-TOF operanti in modalit\u00e0 reflectron (M@ldi-RE), lineare (M@ldilin) e lineare\/reflectron (Voyager-Pro)<\/span><\/li>\n
      • Spettrometro di massa a trappola ionica LCQ Deca XP Max accoppiato al sistema cromatografico Surveyor MS (ThermoFinnigan)<\/span><\/li>\n
      • Spettrometro di massa GCT (Micromass) accoppiato ad un gascromatografo<\/span><\/li>\n
      • Spettrometro di massa con sorgente ICP, ELEMENT2 (ThermoFinnigan)<\/span><\/li>\n
      • Spettrometro di massa ad alta risoluzione con analizzatore a settore magnetico, accoppiato a un gas-cromatografo per l’analisi di microinquinanti organici<\/span><\/li>\n
      • Spettrometro di massa accoppiato a un gascromatografo con sistema di spazio di testa dinamico (Agilent-Gerstel)<\/span><\/li>\n
      • Spettrometro di massa a mobilit\u00e0 ionica portatile RAID M-100 (Bruker)<\/span><\/li>\n
      • Sistemi cromatografici analitici<\/span><\/li>\n
      • Cappe chimiche e a flusso laminare<\/span><\/li>\n
      • Incubatori<\/span><\/li>\n
      • Stazioni grafiche per modellamento molecolare e relativo software<\/span><\/li>\n<\/ul>\n

        – Tecniche d’indagine (metodologie per la comprensione di fenomeni o strutture attraverso l’impiego combinato di competenze e strumentazione)<\/em><\/strong><\/span><\/p>\n

        Studio strutturale di bio-molecole (proteine, peptidi, glicidi, lipidi) mediante MS a singolo stadio, tandem e multicollisionale<\/span><\/p>\n

        Identificazione di proteine separate mediante 1D e 2D-elettroforesi e studio di modifiche posttraduzionali (fosforilazione, glicosilazione)<\/span><\/p>\n

        Proteomica per lo studio di microrganismi, di alimenti e di sistemi cellulari modello<\/span><\/p>\n

        Estrazione e analisi quali-quantitativa di metaboliti secondari (polifenoli, alcaloidi, terpenoidi, fitosteroli) da matrici vegetali o alimentari mediante HPLC-MS; HPLC-MS\/MS; HPLC-MSn<\/span><\/p>\n

        Analisi quali-quantitativa di acidi grassi mediante GC-MS e MALDI-TOF MS<\/span><\/p>\n

        Rivelazioni di adulterazioni in oli alimentari e analisi di prodotti di termossidazione lipidica<\/span><\/p>\n

        Analisi quali-quantitativa di composti volatili, metalli e xenobiotici mediante MS<\/span><\/p>\n

        Metodologie di “molecular profiling” per valutare l’autenticit\u00e0 di alimenti e identificare<\/span><\/p>\n

        microrganismi.<\/span><\/p>\n

        Isolamento e caratterizzazione di microrganismi.<\/span><\/p>\n

        Metodiche di biologia molecolare per lo studio delle interazioni proteina\/DNA<\/span><\/p>\n

        Metodologie bioinformatiche e di biologia computazionale per studi di dinamica molecolare,<\/span><\/p>\n

        struttura-funzione di proteine e di molecole di interesse biologico<\/span><\/p>\n

        – Tecnologie (Metodologie di modellazione o di intervento su oggetti e sistemi) Collaborazioni (partner e committenti)<\/em><\/strong><\/span><\/p>\n

          \n
        • CNR: ISPAAM (Dr. A. Scaloni), ICB-Sez. Napoli (Dr. A. Gambacorta, Dr. A. Fontana), ICB-Sez. Sassari (Dr. G. Palmieri), IGV-Sez. Napoli (Dr. S. Grillo), IGV Sez. Bari (Dr. G. Sonnante); IBP<\/span><\/li>\n
        • (Dr. S. D’Auria, Dr. F. La Cara), ISMN-Sez. di Roma 2 (Dr. A. Curulli ); ISPA \u2013 Sez. di Bari (Dr. S. Vanadia);<\/span><\/li>\n
        • Universit\u00e0 degli Studi di Napoli “Federico II”: Dip. di Chimica Organica e Biochimica (Prof. G. Marino); Dip. di Scienze degli Alimenti (Prof. F. Addeo, Prof. L. Chianese, Prof. P. Ferranti, Prof. G. Mauriello); Dip. di Medicina Pubblica e Sicurezza Sociale (Prof. A. Acampora); Dip. di Scienze del Suolo, della Pianta, dell’Ambiente e delle Produzioni Animali (Dr. A. Di Matteo, Dr. M. Ercolano); Dip. di Biologia e Patologia Cellulare e Molecolare (Prof. E. Avvedimento e Prof. L. Chiariotti);<\/span><\/li>\n
        • Seconda Universit\u00e0 degli Studi di Napoli: CRISCEB (prof. G. Colonna), Dip. di Scienze della Vita (Prof. A. Parente, Prof. G. Aliotta), Centro Interdipartimentale Ricerca e Management (Prof. N. Sannolo); Dipartimento di Patologia Generale (Prof. C. Abbondanza); Dip. di Scienze Ambientali (Prof. M. Sacco);<\/span><\/li>\n
        • Universit\u00e0 degli Studi di Salerno: Dip. di Scienze Farmaceutiche (Prof. C. Pizza); Dip. di Chimica (Prof. C. Esposito);<\/span><\/li>\n
        • Universit\u00e0 degli Studi di Bari- Dip. PROGESA (Prof. A. Di Luccia);.<\/span><\/li>\n
        • Universit\u00e0 del Molise- Dip. di Scienze della Salute (Prof. F. Gentile)<\/span><\/li>\n
        • Universit\u00e0 di Bologna- Dip. di Scienze Farmaceutiche (Prof. P. Brigidi)<\/span><\/li>\n
        • Universit\u00e0 della Tuscia (Prof. E. Poerio, Dr. F. Buonocore);<\/span><\/li>\n
        • Universit\u00e0 di Milano- Dip. di Scienze Molecolari Agroalimentari (Prof. F. Bonomi e Prof. S. Iametti)<\/span><\/li>\n
        • Istituto Zooprofilattico Sperimantale del Mezzoggiorna (Dr. A. Limone e Dr.L. Serpe)<\/span><\/li>\n
        • Istituto Superiore di Sanit\u00e0 (Dr. F. Facchiano, Dr. F. Superti);<\/span><\/li>\n
        • Istituto Nazionale Tumori \u2013 Fondazione G. Pascale (Prof. G. Castello);<\/span><\/li>\n
        • UNESP Departamento de Qu\u00edmica Org\u00e2nica, Araraquara, SP- Brasil (Prof. W. Vilegas, Prof. L. Campaner dos Santos).<\/span><\/li>\n<\/ul>\n

          Potenziale impiego<\/strong><\/span><\/p>\n

          – per processi produttivi<\/em><\/strong><\/span><\/p>\n

          Messa a punto di procedure analitiche rapide e accurate da impiegare per il monitoraggio di processi produttivi e per la valutazione dell’autenticit\u00e0, della qualit\u00e0 e della tipicit\u00e0 del prodotto.<\/span><\/p>\n

          Valorizzazione e sviluppo di prodotti (ad esempio, alimenti tipici o funzionali) attraverso valutazioni qualitative e quantitative di molecole di particolare interesse sia in campo alimentare che farmacologico.<\/span><\/p>\n

          Analisi quantitativa di elementi in tracce negli alimenti trasformati e non.<\/span><\/p>\n

          Progettazione molecolare assistita da modellamento al computer.<\/span><\/p>\n

          – per risposte a bisogni individuali e collettivi<\/em><\/strong><\/span><\/p>\n

          Messa a punto di metodologie proteomiche, metabolomiche e di “molecular profiling” per la determinazione di biomarcatori specifici in sistemi di interesse nel campo delle scienze dell’alimentazione, anche in relazione alla valutazione dell’autenticit\u00e0, della qualit\u00e0 e della sicurezza d’uso del prodotto.<\/span><\/p>\n

          Caratterizzazione di matrici alimentari e identificazione di molecole con particolari attivit\u00e0 nutrizionali e con specifiche attivit\u00e0 biologiche, al fine di valorizzarne l’utilizzo in alimenti specifici per particolari classi di consumatori (alimenti funzionali).<\/span><\/p>\n

          Obiettivi:<\/strong><\/span><\/p>\n

          – sviluppo di metodologie innovative, basate in particolare sulle discipline “omiche”, da utilizzare nello studio di sistemi biologici di importanza nelle scienze dell’alimentazione;<\/span><\/p>\n

          – utilizzo di metodologie basate sulla spettrometria di massa e di strategie di “molecular profiling” per affrontare in maniera innovativa problematiche inerenti la chimica, biochimica e tecnologia degli alimenti anche al fine di sviluppare strumenti analitici rapidi, accurati e affidabili, per il controllo della qualit\u00e0, autenticit\u00e0 e sicurezza alimentare;<\/span><\/p>\n

          – studio con metodi bioinformatici e computazionali delle basi di meccanismi molecolari di interesse quali interazione proteina-proteina e proteina-ligando.<\/span><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

          Metodologie di Spettrometria di Massa, Proteomica, Metabolomica e Bioinformatica nelle Scienze dell’Alimentazione Tematiche di ricerca WP1: Proteomica e Metabolomica nelle scienze dell’alimentazione; – Studio dei meccanismi molecolari alla base delle interazioni tra alimenti e salute dell’uomo,attraverso l’analisi di sistemi cellulari modello – Studio dei meccanismi epigenetici alla base della regolazione da estrogeni e fitoestrogeni di […]<\/p>\n","protected":false},"author":2,"featured_media":0,"parent":78,"menu_order":311,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"ngg_post_thumbnail":0,"footnotes":""},"class_list":["post-89","page","type-page","status-publish","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/webisa\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/89","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/webisa\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/webisa\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/webisa\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/2"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/webisa\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=89"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/webisa\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/89\/revisions"}],"up":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/webisa\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/78"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/webisa\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=89"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}