{"id":151,"date":"2010-03-15T12:34:41","date_gmt":"2010-03-15T12:34:41","guid":{"rendered":"http:\/\/www.isa.cnr.it\/wp-isa\/?p=151"},"modified":"2010-03-15T12:34:41","modified_gmt":"2010-03-15T12:34:41","slug":"studi-strutturali-sulla-proteina-ph-sbp-mediante-metodi-bioinformatici-2003","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/?p=151","title":{"rendered":"Studi strutturali sulla proteina Ph-SBP mediante metodi bioinformatici (2003)"},"content":{"rendered":"<p style=\"text-align: justify;\">Nell\u2019ambito di uno studio in collaborazione tra l\u2019Istituto di Scienze\u00a0dell\u2019Alimentazione (CNR, Avellino) e l\u2019Istituto di Biochimica delle\u00a0Proteine (CNR, Napoli) \u00e8 stato costruito un modello teorico della\u00a0struttura tridimensionale della proteina Ph-SBP, una proteina del\u00a0microorganismo Pyrococcus horikoshii. Il modellamento, realizzato presso\u00a0il laboratorio di Bioinformatica dell\u2019Istituto di Scienze\u00a0dell\u2019Alimentazione,<br \/>\n<!--more-->\u00e8 stato oggetto di una recente pubblicazione (Marabotti A, D&#8217;Auria S, Rossi M, Facchiano AM. Theoretical model of the three-dimensional structure of a sugar-binding protein from Pyrococcus horikoshii: structural analysis and sugar-binding simulations. Biochem\u00a0J. 2004 Jun 15; 380: 677-684) ed ha ricevuto particolare rilievo con la\u00a0pubblicazione della struttura della proteina sulla copertina dei numeri\u00a0del volume 381 della rivista Biochemical Journal.<br \/>\nL\u2019interesse per questa proteina deriva dalla sua particolare funzione: \u00e8\u00a0infatti in grado di riconoscere in modo selettivo una classe di zuccheri\u00a0e di legarli a s\u00e9, trasportandoli nella cellula. Un\u2019altra importante\u00a0caratteristica della Ph-SBP \u00e8 dovuta alle propriet\u00e0 del microorganismo\u00a0da cui deriva, un batterio ipertermofilo, ovvero in grado di crescere a<br \/>\ntemperature superiori ai 100 \u00b0C, il che rende la proteina\u00a0particolarmente stabile e quindi di facile utilizzo nelle applicazioni\u00a0biotecnologiche.<br \/>\nIl lavoro svolto \u00e8 partito dalla analisi della sequenza di amminoacidi\u00a0della Ph-SBP con metodi bioinformatici che hanno permesso di individuare\u00a0altre proteine aventi la stessa funzione in altri organismi. Da queste\u00a0ulteriori informazioni, \u00e8 stato possibile utilizzare la tecnica del\u00a0modellamento per omologia per creare un modello verosimile della\u00a0struttura tridimensionale della Ph-SBP. Questo modello \u00e8 stato quindi\u00a0sottoposto a diverse verifiche per la sua qualit\u00e0 strutturale, il cui\u00a0superamento ci ha permesso di depositare la struttura nella banca dati\u00a0internazionale PDB.<br \/>\nLa disponibilit\u00e0 di questo modello apre una serie di interessanti\u00a0prospettive sia per la conoscenza approfondita delle relazioni\u00a0struttura-funzione di questa particolare proteina, sia per le sue\u00a0possibili applicazioni. Per fare un esempio, per la sua particolare\u00a0funzione e stabilit\u00e0 questa proteina \u00e8 un ottimo candidato come\u00a0componente di biosensori, ovvero strumenti che sfruttano molecole di\u00a0origine biologica integrate in sofisticate strumentazioni elettroniche\u00a0per realizzare dispositivi diagnostici, in questo caso utilizzabili per\u00a0la valutazione della concentrazione di zuccheri in fluidi biologici. La\u00a0conoscenza del modello tridimensionale della proteina permette anche di\u00a0progettare specifiche modifiche strutturali, allo scopo di adattare le\u00a0sue caratteristiche funzionali a particolari applicazioni. Nel futuro,\u00a0strumenti di questo tipo permetteranno di valutare parametri clinici in\u00a0modo semplice, non invasivo e in grado di dare un monitoraggio continuo\u00a0del parametro in esame.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><a href=\"http:\/\/www.cnr.it\/istituti\/?LO=01000000d9c8b7a60400000004000000ce5e01001b1cbb43000000000100000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000&amp;type=image\/jpeg\" target=\"new_\">Immagine &#8211; Modello della proteina Ph-SBP<\/a><br \/>\n<a href=\"http:\/\/www.cnr.it\/istituti\/?LO=01000000d9c8b7a60400000004000000215e01006e1bbb43000000000100000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000&amp;type=application\/pdf\" target=\"new_\">Documento &#8211; Articolo: Marabotti et. al. Biochem<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Nell\u2019ambito di uno studio in collaborazione tra l\u2019Istituto di Scienze\u00a0dell\u2019Alimentazione (CNR, Avellino) e l\u2019Istituto di Biochimica delle\u00a0Proteine (CNR, Napoli) \u00e8 stato costruito un modello teorico della\u00a0struttura tridimensionale della proteina Ph-SBP, una proteina del\u00a0microorganismo Pyrococcus horikoshii. Il modellamento, realizzato presso\u00a0il laboratorio&#8230;<br \/><a class=\"read-more-button\" href=\"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/?p=151\">Leggi il seguito<\/a><\/p>\n","protected":false},"author":3,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"ngg_post_thumbnail":0,"footnotes":""},"categories":[8],"tags":[34,228,83,87],"yoast_head":"<!-- This site is optimized with the Yoast SEO plugin v23.5 - https:\/\/yoast.com\/wordpress\/plugins\/seo\/ -->\n<title>Studi strutturali sulla proteina Ph-SBP mediante metodi bioinformatici (2003) - ISTITUTO DI SCIENZE DELL&#039; ALIMENTAZIONE - CNR<\/title>\n<meta name=\"robots\" content=\"index, follow, max-snippet:-1, max-image-preview:large, max-video-preview:-1\" \/>\n<link rel=\"canonical\" href=\"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/?p=151&amp;lang=it\" \/>\n<meta property=\"og:locale\" content=\"it_IT\" \/>\n<meta property=\"og:type\" content=\"article\" \/>\n<meta property=\"og:title\" content=\"Studi strutturali sulla proteina Ph-SBP mediante metodi bioinformatici (2003) - ISTITUTO DI SCIENZE DELL&#039; ALIMENTAZIONE - CNR\" \/>\n<meta property=\"og:description\" content=\"Nell\u2019ambito di uno studio in collaborazione tra l\u2019Istituto di Scienze\u00a0dell\u2019Alimentazione (CNR, Avellino) e l\u2019Istituto di Biochimica delle\u00a0Proteine (CNR, Napoli) \u00e8 stato costruito un modello teorico della\u00a0struttura tridimensionale della proteina Ph-SBP, una proteina del\u00a0microorganismo Pyrococcus horikoshii. Il modellamento, realizzato presso\u00a0il laboratorio...Leggi il seguito\" \/>\n<meta property=\"og:url\" content=\"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/?p=151&amp;lang=it\" \/>\n<meta property=\"og:site_name\" content=\"ISTITUTO DI SCIENZE DELL&#039; ALIMENTAZIONE - CNR\" \/>\n<meta property=\"article:published_time\" content=\"2010-03-15T12:34:41+00:00\" \/>\n<meta name=\"author\" content=\"Autore\" \/>\n<meta name=\"twitter:label1\" content=\"Scritto da\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data1\" content=\"Autore\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:label2\" content=\"Tempo di lettura stimato\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data2\" content=\"2 minuti\" \/>\n<script type=\"application\/ld+json\" class=\"yoast-schema-graph\">{\"@context\":\"https:\/\/schema.org\",\"@graph\":[{\"@type\":\"WebPage\",\"@id\":\"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/?p=151&amp;lang=it\",\"url\":\"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/?p=151&amp;lang=it\",\"name\":\"Studi strutturali sulla proteina Ph-SBP mediante metodi bioinformatici (2003) - ISTITUTO DI SCIENZE DELL&#039; ALIMENTAZIONE - CNR\",\"isPartOf\":{\"@id\":\"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/#website\"},\"datePublished\":\"2010-03-15T12:34:41+00:00\",\"dateModified\":\"2010-03-15T12:34:41+00:00\",\"author\":{\"@id\":\"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/#\/schema\/person\/aa493e8be6de9167a1f1026191c3d217\"},\"breadcrumb\":{\"@id\":\"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/?p=151&amp;lang=it#breadcrumb\"},\"inLanguage\":\"it-IT\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"ReadAction\",\"target\":[\"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/?p=151&amp;lang=it\"]}]},{\"@type\":\"BreadcrumbList\",\"@id\":\"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/?p=151&amp;lang=it#breadcrumb\",\"itemListElement\":[{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":1,\"name\":\"Home\",\"item\":\"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/\"},{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":2,\"name\":\"Studi strutturali sulla proteina Ph-SBP mediante metodi bioinformatici (2003)\"}]},{\"@type\":\"WebSite\",\"@id\":\"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/#website\",\"url\":\"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/\",\"name\":\"ISTITUTO DI SCIENZE DELL&#039; ALIMENTAZIONE - CNR\",\"description\":\"INSTITUTE OF FOOD SCIENCES - CNR\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"SearchAction\",\"target\":{\"@type\":\"EntryPoint\",\"urlTemplate\":\"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/?s={search_term_string}\"},\"query-input\":{\"@type\":\"PropertyValueSpecification\",\"valueRequired\":true,\"valueName\":\"search_term_string\"}}],\"inLanguage\":\"it-IT\"},{\"@type\":\"Person\",\"@id\":\"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/#\/schema\/person\/aa493e8be6de9167a1f1026191c3d217\",\"name\":\"Autore\",\"image\":{\"@type\":\"ImageObject\",\"inLanguage\":\"it-IT\",\"@id\":\"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/#\/schema\/person\/image\/\",\"url\":\"https:\/\/secure.gravatar.com\/avatar\/defadbbff77601fd0b30f13526f9b00a?s=96&d=mm&r=g\",\"contentUrl\":\"https:\/\/secure.gravatar.com\/avatar\/defadbbff77601fd0b30f13526f9b00a?s=96&d=mm&r=g\",\"caption\":\"Autore\"},\"url\":\"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/?author=3\"}]}<\/script>\n<!-- \/ Yoast SEO plugin. -->","yoast_head_json":{"title":"Studi strutturali sulla proteina Ph-SBP mediante metodi bioinformatici (2003) - ISTITUTO DI SCIENZE DELL&#039; ALIMENTAZIONE - CNR","robots":{"index":"index","follow":"follow","max-snippet":"max-snippet:-1","max-image-preview":"max-image-preview:large","max-video-preview":"max-video-preview:-1"},"canonical":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/?p=151&amp;lang=it","og_locale":"it_IT","og_type":"article","og_title":"Studi strutturali sulla proteina Ph-SBP mediante metodi bioinformatici (2003) - ISTITUTO DI SCIENZE DELL&#039; ALIMENTAZIONE - CNR","og_description":"Nell\u2019ambito di uno studio in collaborazione tra l\u2019Istituto di Scienze\u00a0dell\u2019Alimentazione (CNR, Avellino) e l\u2019Istituto di Biochimica delle\u00a0Proteine (CNR, Napoli) \u00e8 stato costruito un modello teorico della\u00a0struttura tridimensionale della proteina Ph-SBP, una proteina del\u00a0microorganismo Pyrococcus horikoshii. Il modellamento, realizzato presso\u00a0il laboratorio...Leggi il seguito","og_url":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/?p=151&amp;lang=it","og_site_name":"ISTITUTO DI SCIENZE DELL&#039; ALIMENTAZIONE - CNR","article_published_time":"2010-03-15T12:34:41+00:00","author":"Autore","twitter_misc":{"Scritto da":"Autore","Tempo di lettura stimato":"2 minuti"},"schema":{"@context":"https:\/\/schema.org","@graph":[{"@type":"WebPage","@id":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/?p=151&amp;lang=it","url":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/?p=151&amp;lang=it","name":"Studi strutturali sulla proteina Ph-SBP mediante metodi bioinformatici (2003) - ISTITUTO DI SCIENZE DELL&#039; ALIMENTAZIONE - CNR","isPartOf":{"@id":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/#website"},"datePublished":"2010-03-15T12:34:41+00:00","dateModified":"2010-03-15T12:34:41+00:00","author":{"@id":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/#\/schema\/person\/aa493e8be6de9167a1f1026191c3d217"},"breadcrumb":{"@id":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/?p=151&amp;lang=it#breadcrumb"},"inLanguage":"it-IT","potentialAction":[{"@type":"ReadAction","target":["https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/?p=151&amp;lang=it"]}]},{"@type":"BreadcrumbList","@id":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/?p=151&amp;lang=it#breadcrumb","itemListElement":[{"@type":"ListItem","position":1,"name":"Home","item":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/"},{"@type":"ListItem","position":2,"name":"Studi strutturali sulla proteina Ph-SBP mediante metodi bioinformatici (2003)"}]},{"@type":"WebSite","@id":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/#website","url":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/","name":"ISTITUTO DI SCIENZE DELL&#039; ALIMENTAZIONE - CNR","description":"INSTITUTE OF FOOD SCIENCES - CNR","potentialAction":[{"@type":"SearchAction","target":{"@type":"EntryPoint","urlTemplate":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/?s={search_term_string}"},"query-input":{"@type":"PropertyValueSpecification","valueRequired":true,"valueName":"search_term_string"}}],"inLanguage":"it-IT"},{"@type":"Person","@id":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/#\/schema\/person\/aa493e8be6de9167a1f1026191c3d217","name":"Autore","image":{"@type":"ImageObject","inLanguage":"it-IT","@id":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/#\/schema\/person\/image\/","url":"https:\/\/secure.gravatar.com\/avatar\/defadbbff77601fd0b30f13526f9b00a?s=96&d=mm&r=g","contentUrl":"https:\/\/secure.gravatar.com\/avatar\/defadbbff77601fd0b30f13526f9b00a?s=96&d=mm&r=g","caption":"Autore"},"url":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/?author=3"}]}},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/151"}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/3"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=151"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/151\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=151"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=151"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.isa.cnr.it\/web\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=151"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}